粉碎性骨折的部位不同，表现出的后遗症也会不一样。如果是四肢骨折，常见的后遗症是四肢外观畸形及力线改变。如果是关节的粉碎性骨折，可能出现的后遗症有关节僵硬、活动障碍及创伤性关节炎。

如果是脊柱的粉碎性骨折，相应脊柱平面的支配神经可能出现问题，也可能导致局部疼痛甚至截瘫。如果是锁骨的骨折，容易出现一边锁骨更短，从而呈现出一侧肩膀更短的畸形外观，影响美观。