跑步膝盖疼痛，这种疼痛也分好几种。可能是急性扭伤导致的疼痛，也可能是局部韧带或者半月板损伤导致的疼痛。对于急性扭伤，两天内可以冷敷处理，两天后改为热敷，并局部应用活血化瘀的药膏治疗。

如果休息几天后疼痛仍然没有缓解，建议到医院进行膝关节的检查，必要时进行膝关节核磁检查，进一步的诊断有无韧带、半月板的损伤，从而决定下一步的治疗。如果是半月板损伤，严重的话需要关节镜处理。