跑步后膝盖疼痛有很多原因，常见的是髌骨软化症，这时候需要避免跑步，注意关节的休息和保暖，外用消炎止痛膏药治疗。也可以吃一些营养软骨的药物，帮助修复关节软骨。

跑步膝盖疼痛也可能是膝关节周围的软组织炎症所引起的，这种情况下的治疗原则是休息、热敷、理疗、外用膏药，同时吃非甾体类抗炎药。如果疼痛非常严重，要排除是否有半月板或者韧带损伤，建议及时去医院检查。